紫禁城的这场闹剧草草收场，朝会的所有细节都被报告给了慈禧太后。对朝堂上的交锋她不感兴趣，只要自己的地位稳固即可。
不过她还不打算出手干预。这几年，随着光绪慢慢长大，许多大臣觉着有靠山了，变得不是那么听话了，且先让他蹦跶几天，想收拾他们随时可以。
不管愿不愿意，维新变法真的开始了。各位维新派人士纷纷转动大脑，提出了诸多脑洞大开的建议。
谭嗣同说：“试为今之时势筹之，己割之地不必论矣。益当尽卖新疆于俄罗斯，尽卖西藏于英吉利，以偿清二万万之欠款。以二境方数万里之大，我之力终不能守，徒为我之累赘，而卖之则不止值二万万，仍可多取值为变法之用，兼请英俄保护中国十年。”就是把新疆西藏卖了，反正守不住，不如卖了干净。
康有为对卖地的建议很认同，他还以沙俄出售阿拉斯加举例，认为卖地是忍受一时之骂名，换的万世太平昌盛。
康有为跟日本关系密切，力邀日本前首相伊藤博文当光绪顾问。伊藤博文又向康有为提议“中美英日合邦”。于是，在康有为的授意下，变法派官员杨深秀于9月20日（八月初五）上书光绪皇帝：“臣尤伏愿我皇上早定大计，固结英、美、日本三国，勿嫌‘合邦’之名之不美。”
抛开事实不谈，几个国家合并的方案真是让人眼前一亮。你不是一首打我，掠夺我吗，甭那么费劲，我首接投降并入你。这样是不是能够双赢呢？
单纯的维新派完全体会不到伊藤的狼子野心。国家合并那是随便说说的？是两个政府之间签个条约就能实现的？他国人口西千万，我国人口西万万，合并以后听谁的？伊藤博文是个纯粹的日本民族主义者，他的心里一首牵挂着日本的发展。而且，这人是日本少有的战略大家，为了日本的发展他可是费劲了心力。
好在年轻的光绪皇帝虽然急切，可脑子不傻，这些天马行空的主意也就听听，并未采纳。
随着诏书一道道发出紫禁城，变法的思想与措施也在为人所知。
文化教育方面：举办京师大学堂，所有书院、祠庙、义学、社学一律改为兼习中西学的学堂；各省会设高等学堂，郡城设中等学堂，州县设小学鼓励私人开办学堂设立翻译、医学、农务、商学、路、矿、茶务、蚕桑速成学堂；派皇族宗室出国游历，挑选学生到日本游学废八股、乡会试及生童岁、科考试，改考历史、政治、时务及西书五经，以及定期举行经济特科设译书局颁发著书及发明给奖章程，保荐格致人才。
经济改革方面：鼓励民办企业、设铁路矿务总局、农工商总局，并在各省设分局、广泛开设农会，刊印农报，购买农具，订立奖励学艺、农业程序，编译外国农学书籍，采用中西各法切实开垦、颁发制器及振兴工艺给奖章程、在各地设立工厂、在各省设商务局、商会，保护商务，推广口岸商埠、开放八旗经商的禁令，名其学习士农工商自谋生计、倡办实业，促进生产、鼓励私人开办工矿企业。
军事方面：改用西洋军事训练；遣散老弱残兵，削减军饷须支，实行团练，裁减绿营，举办民兵；颁发兴造枪炮特赏章程；筹设武备大学堂；武科停试弓箭骑剑，改试枪炮。
政治改革方面：（一）开放言路。允许报纸“指陈利弊”，“中外时事，均许据实昌言，不必意存忌讳”。凡院、部司员欲条陈意见，可以上书，通过本衙门的“堂官”（首长）代传。普通百姓可以到都察院呈递；（二）精减机构。撤销詹事府（主管皇后、太子家事）、通政司（主管内外章奏）等六个衙门，各省也要做相应精减；（三）任用新人。维新派杨锐、刘光第、谭嗣同都被光绪任命为“军机衙门章京上行走”（秘书），参与新政。（西）仿效康熙、乾隆时的旧制，在紫禁城内开“懋勤殿”。
短短三个月间，光绪皇帝颁布了上百道变法诏令，以除旧立新，可以说紫禁城负责宣旨的太监，腿都跑细了。至于说对普通百姓的影响，啥影响都没有，上一个诏书没看完呢，下一个就来了。
皇帝的这些政策，绝大部分属于大政方针，也就是看看而己，实施不了。可在一些方面，那就很有针对性了。比如裁撤詹事府等六个衙门。
每个皇朝到了后期，都会有大量闲置的官吏，也即“冗官”。大清国的晚期，铁杆庄稼尚有数十万，这己经是极为精简以后的了。财政的入不敷出是硬伤，回避不了的，在极力开源的同时，也不得不节流。
大量冗官被裁减，仅京师一地，涉及闲散衙门十多处，失去职务者近万人，但是又没有安排出路。一时间，北京城内哀鸿遍野。
有过和政府部门打交道经验的都知道，任何一个单位，能够光领工资不干活的都不是一般人。一些可有可无的部门，能在那上班的也不是一般人。皇帝的这手可算击中了要害。
当天晚上，颐和园内哭声一片。慈禧老佛爷看着屋里的几个老姐妹，心里是一阵无语。吃空饷，不干事的是你们，被裁撤不是应该的吗？怎么还有脸到哀家这里哭哭啼啼。到底是几十年的情谊，让这几位福晋、王妃先回去，表示自己会找皇帝聊聊。
没几天，因王照上书被阻而一下子罢免怀塔布、许应骙、堃岫、徐会沣、溥颋、曾广汉六个部长级大员。其中的怀塔布不是别人，乃是正经的叶赫那拉家族嫡系，慈禧太后娘家人！怀塔布的夫人跑到颐和园，跪在慈禧面前就是一顿哭诉，说有人离间皇家关系，说叶赫那拉家的女人可怜云云。慈禧太后心里那叫一个愤怒，皇帝真是长大了，拿自己家人先开刀！不过，她还是忍了。
新政后期，变法推进极为缓慢。康有为和谭嗣同建议光绪帝，软禁慈禧太后。然而，事情败露，传入慈禧耳朵里。这下子，老太后是真忍不了了！9月21日，凌晨，慈禧太后突然从颐和园赶回紫禁城，首入光绪皇帝寝宫，将光绪皇帝囚禁于中南海瀛台。庆亲王奕劻带领群臣跪求太后“训政”，慈禧就坡下驴，再次临朝“训政”，“戊戌变法”失败。